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生信怎么学

问答中心分类: 其他生信怎么学
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夏伤っ 回复于 2024-12-03 之前

姐妹们!兄弟们!最近好多人私信问我,生信怎么学?感觉入门好难!真的吗?其实并没有!今天就来手把手教你,从小白进阶生信达人,拿捏住每一个知识点!不用焦虑,跟着我一起学起来!

✨首先,我们要搞清楚,啥是生信?

简单来说,就是用计算机来处理和分析生物数据,比如基因啊、蛋白质啊等等。现在生物数据爆炸式增长,没有生信分析,很多研究根本进行不下去。所以,学会生信,绝对是未来科研的必备技能,也是升职加薪的利器!

💖那么,如何入门生信呢?敲黑板,重点来啦!

第一步:编程语言,Python或R,选一个!

不用两个都学,时间成本太高!推荐Python,语法简洁易懂,库也更丰富。先把基础语法搞定,然后学习常用的库,比如NumPy、Pandas、Scikit-learn等等。不用追求完美,够用就行!网上资源很多,B站、Coursera、慕课等等,都有免费的优质课程,比如“小甲鱼的Python教程”、“Python数据分析与机器学习实战”。跟着学,坚持练习,一个月就能入门!

第二步:Linux系统,必须掌握!

大部分生信分析都是在Linux系统下进行的。别害怕,其实不难!装个虚拟机,比如VirtualBox或者VMware,然后装个Ubuntu系统,跟着教程一步步操作就行。先学习基本的命令,比如文件操作、目录切换、进程管理等等。推荐“鸟哥的Linux私房菜”,讲得很详细,也很有趣。

第三步:生信工具和数据库,逐步学习!

这部分内容比较多,需要根据自己的研究方向选择性学习。比如,做基因组分析,就要学习GATK、BWA、Samtools等工具,以及NCBI、Ensembl等数据库;做转录组分析,就要学习HISAT2、StringTie、DESeq2等工具,以及GEO、ArrayExpress等数据库;做蛋白质组分析,就要学习MaxQuant、Mascot等工具,以及UniProt、PDB等数据库。不用一口气全部学会,先了解常用的,用到的时候再深入学习。

第四步:统计学和生物学知识,必不可少!

生信分析离不开统计学,比如假设检验、p值、多重检验等等。不用成为统计学专家,但基本的统计学概念一定要懂。推荐“深入浅出统计学”,图文并茂,很容易理解。另外,也要有一定的生物学基础,才能理解数据的意义,才能设计合理的分析方案。

第五步:实践出真知,多做项目!

学习生信最好的方法就是实践。可以找一些公开的数据集,或者参与一些开源项目,跟着大佬们学习。也可以参加一些生信培训班,比如华大基因学院、中国科学院大学的生信课程等等,系统学习,还能结识同行,交流经验。

💖给大家推荐一些学习资源:

书籍:

“Python编程:从入门到实践”

“鸟哥的Linux私房菜”

“深入浅出统计学”

“生物信息学:序列与基因组分析”

网站:

Biostars:生信问答社区,遇到问题可以在这里提问

GitHub:代码托管平台,可以找到很多开源的生信工具和项目

NCBI:美国国立生物技术信息中心,包含大量的生物数据和工具

💖学习小技巧:

制定学习计划,坚持学习,不要三天打鱼两天晒网。

多练习,多实践,熟能生巧。

加入生信学习群,与同行交流,互相学习,共同进步。

关注一些生信公众号,比如“生信技能树”、“碱基矿工”、“生信人”等等,获取最新的资讯和学习资源。

💖最后,送给大家一句话:学习生信,贵在坚持!只要坚持学习,不断实践,就一定能掌握这门技能,在科研的道路上越走越远!

希望这篇笔记对你有帮助!记得点赞收藏哦!一起加油!冲鸭!

 

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